福建深沪湾海底古森林遗迹于1992年被国务院确定为国家级自然保护区。它位于全国著名侨乡福建省晋江市的东南端，其具体位置为范围线联结点的地理座标是。保护区总面积27平方公里，其中海域面积22平方公里，陆域面积5平方公里。 　　保护区以保护已有7000多年历史的海底古森林遗迹为核心，还包括海湾内的牡蛎礁和海岸自然地质地貌、名胜古迹、防风林带以及石圳海岸海蚀变质岩自然剖面。 建深沪湾海底古森林遗迹自然保护区位于台湾海峡西岸中段，著名的平潭－南澳变质带中部，福建晋江半岛东南端的深沪湾内，以保护7500年前的古树桩遗迹、9000年－25000年前的已胶结古牡蛎礁、石圳海岸变质岩区、老红砂分布区和海岸沙丘等地质景观为主要内容，全区面积27平方公里。自1986年发现以来，先后于1990年6月被定为县级保护区，1992年被国务院确立为国家级海洋自然保护区。